O objetivo deste estudo foi avaliar a capacidade de degradação do petróleo e de produção de biossurfactantes, além de demonstrar a dinâmica da comunidade bacteriana do sedimento de dois manguezais, com diferentes características físicoquímicas e históricos de contaminação por petroderivados, durante o processo degradativo do óleo in vitro. Duas amostras de cada manguezal foram analisadas quanto à quantidade de HPAs, salinidade, pH, granulometria e teores de Corg e N. As amostras foram incubadas com 2% de petróleo submetidas à contagem de bactérias heterotróficas totais e degradadoras de petróleo a cada 7 dias, durante 28 dias e, novamente, após a degradação visual do poluente, aos 150 dias, até 178 dias de experimento. Alíquotas do sedimento foram obtidas nos dias 0 (antes da inserção do petróleo), 7, 14, 21, 28, 60, 90, 120 e 150 para avaliação da diversidade bacteriana pela técnica de T-RFLP. Após a adição do contaminante, observou-se um aumento significativo da contagem de bactérias heterotróficas totais, causado pelo crescimento de linhagens degradadoras. A presença do poluente também estimulou o crescimento de bactérias com capacidade de produzir biossurfactantes em todas as amostras analisadas, confirmando a capacidade degradativa das bactérias autóctones. A análise de T-RFLP demonstrou que, antes da incubação com o petróleo, as amostras do manguezal de Gargaú apresentaram maior diversidade bacteriana do que o da Baía de Guanabara. Após 7 dias de experimento, houve redução da diversidade para três das amostras analisadas, enquanto uma delas apresentou aumento da diversidade bacteriana, sugerindo que os fatores ambientais são determinantes para o crescimento bacteriano na presença do petróleo. Foi possível notar a presença de filotipos sensíveis e resistentes à toxicidade do petróleo, possibilitando a seleção de bactérias de interesse biotecnológico, com capacidade de utilizar este poluente como fonte de carbono para o seu crescimento. Não foi possível detectar um padrão quanto à composição de filotipos e mudança da diversidade, no entanto, aparentemente houve um padrão de sucessão de filotipos que se dividiu em fases, que provavelmente, se relacionam ao estado de degradação do petróleo.