A construção de alagados artificiais com o intuito de reduzir as quantidades de nutrientes de efluentes tem se tornado uma prática comum nos últimos anos, sendo um sistema utilizado como uma medida preventiva da poluição aquática onde a matéria orgânica será convertida em compostos gasosos através de processos mediados por microorganismos. Alguns destes gases podem apresentar efeitos adversos na atmosfera, uma vez que grande parte dos materiais desta atividade microbiana são os gases responsáveis pelo efeito estufa. Considerando tais vias metabólicas naturais, os alagados construídos, podem ser considerados um risco já que a poluição aquática está sendo evitada com sua utilização, mas está sendo convertida em poluição atmosférica. O presente estudo objetivou conhecer a produção e as possíveis vias de emissão de metano em pequenos alagados construídos analisando os efeitos da eutrofização e o papel das macrófitas aquáticas na circulação do metano nestes ambientes aquáticos. Com base nos objetivos propostos, tanques experimentais foram construídos e abastecidos com material (sedimento, água e macrófitas aquáticas) proveniente de duas lagoas (uma eutrofizadas artificialmente e uma lagoa foi tomada como controle). O processo de experimentação mostrou que os alagados artificiais são capazes de produzir metano e emitir através de bolhas, difusão na coluna d’água e emissão através da comunidade de macrófitas aquáticas emergentes. Foi possível evidenciar a influência positiva do lançamento de efluentes domésticos, aumentando a concentração de matéria orgânica para a metanogênese e reduzindo as concentrações de oxigênio dissolvido no sistema experimental, que também influenciava positivamente o processo de formação de metano. As macrófitas aquáticas mostraram através deste experimento a sua contribuição para a oxidação de suas raízes e rizomas, favorecendo os organismos metanotróficos, e possivelmente são responsáveis pela emissão direta de parte do metano sintetizado no sedimento destes ambientes.