Lagoas costeiras são regiões de transição entre o ambiente continental e marinho, e por isso possuem condições ambientais adversas, sendo característico um gradiente físico-químico ao longo desses ecossistemas. Esses ambientes na região norte do estado do Rio de Janeiro, têm sido expostos a uma série de atividades antrópicas, destacando-se a abertura artificial da barra de areia que as separam do mar. Esse processo termina por alterar as características bióticas e abióticas da coluna da água, causando uma perturbação na ictiofauna desses ecossistemas. Comunidades ícticas são importantes ferramentas na avaliação da qualidade ambiental de corpos hídricos, sendo importante uma avaliação qualitativa e quantitativa em sua estrutura, como base para a implementação de medidas de manejo, conservação e recuperação de áreas degradadas pela atividade humana. Assim, procurou-se caracterizar a taxocenose íctica da lagoa de Iquipari, identificando padrões espaço-temporais de distribuição da ictiofauna, e avaliar o impacto da abertura de barra sobre a comunidade íctica. Para isso foi realizado um esforço amostral de julho de 2008 a maio de 2009. Três sítios amostrais foram estabelecidos, um na região mais próxima ao local onde a barra de areia foi aberta (1), outro na região intermediária (2) e um terceiro no extremo oposto à região onde a barra de areia foi artificialmente aberta (3). O artefato de captura foi rede de espera, com malhas de 20, 30 e 40 mm. Os valores das variáveis físico-químicas foram obtidos para cada sítio amostral. A captura total somou 5452 exemplares distribuídos em 33 espécies dentre marinhas e dulcícolas, 23 famílias e 8 ordens. A espécie mais abundante, em todos os sítios amostrais, foi Cetengraulis edentulus. Em relação a fatores abióticos, observou-se um gradiente sazonal e espacial na salinidade e condutividade, e uma variação sazonal na temperatura da água. Quanto à estrutura da comunidade, a taxocenose íctica mostrou uma distribuição espaço-temporal não estocástica, relacionando-se a um gradiente salino. Após a abertura da barra de areia, a ictiofauna mostrou diferenças nos padrões de distribuição espacial e na composição específica, respondendo de forma negativa, de modo que o número de espécies, a abundância e a biomassa foram reduzidos. Por fim, a ictiofauna da lagoa de Iquipari mostrou sinais de alta perturbação e estresse, necessitando de medidas de manejo e conservação imediatas.